Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3CBP42338 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms