Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms