Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms