Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CRABP1P29762 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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