Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms