Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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