Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CCL3L1P16619 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CCL3L1P16619 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CCL3L1P16619 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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