Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA4P13612 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms