Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms