Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms