Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRATO95237 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRATO95237 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRATO95237 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRATO95237 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRATO95237 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LRATO95237 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRATO95237 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRATO95237 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRATO95237 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRATO95237 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRATO95237 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRATO95237 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRATO95237 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRATO95237 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms