Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB3O75712 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB3O75712 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB3O75712 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB3O75712 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB3O75712 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJB3O75712 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJB3O75712 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms