Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms