Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNMO15061 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNMO15061 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNMO15061 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms