Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3AO14802 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms