Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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