Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms