Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms