Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms