Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCML1Q9UN30 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms