Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms