Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH3Q9UHC1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH3Q9UHC1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms