Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DUX4Q9UBX2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DUX4Q9UBX2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DUX4Q9UBX2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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