Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N8

MARCH2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH2Q9P0N8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MARCH2Q9P0N8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MARCH2Q9P0N8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms