Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms