Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms