Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSPNQ9HAW4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms