Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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