Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms