Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM31Q9BZY9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms