Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms