Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC3Q9BY71 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms