Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCAPERQ9BY12 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAPERQ9BY12 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms