Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM4Q9BWF3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms