Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms