Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms