Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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