Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms