Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms