Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms