Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms