Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOPBP1Q92547 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms