Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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