Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPBAR1Q8TDU6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms