Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AVL9Q8NBF6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms