Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms