Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms