Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms