Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP4R4Q6NUP7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms