Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms